侯宽仁在担任特侦组检察官期间，因侦办前台北市长马英九特别费案，遭马以侦讯笔录不实提出告诉。
新华网消息 据台湾媒体报道，台湾当局领导人马英九在台北市长任内特别费案获判无罪确定后，控告检察官侯宽仁制作笔录不实涉嫌伪造文书，经台北地检署处分不起诉，马英九申请再议被“高检署”驳回。今年三月间，马英九又委任律师向台北地院声请交付审判，地院合议庭尚未裁定，若裁定交付审判，马英九将与检察官侯宽仁对簿公堂。
委任律师：要一个是非
据台湾《中国时报》报道，台北地院行政庭长黄俊明表示，合议庭法官已经向台北地检署等单位调阅卷证，未来若裁定交付审判，视为案件已提起公诉，将由该合议庭进行审理，侯宽仁检察官是被告，可以提起抗告；若是裁定驳回，则全案确定，马英九不能再提抗告。
马英九的委任律师宋耀明表示，马英九会再声请交付审判，是原则问题，把法律程序走完，要的是一个是非，因为马英九的特别费案，检察官的笔录有错误，连判决书都指明与证人证词有许多出入，这是很少见的，检察官笔录有误，不能告诉大家就要默默承受，这样以后老百姓如何相信司法。
侯宽仁：以平常心对待
当事人之一的“高检署”检察官侯宽仁表示，他是看报纸才知道此事，他尊重马英九的诉讼权，也以平常心看待，因他是当事人，不宜对外表示意见。
马英九另告发特侦组检察官周士榆、前特侦组检察官沈明伦及侯宽仁三人，侦办前民进党主席谢长廷秘书陈雨鑫案，涉嫌滥权不起诉渎职，北检也是不起诉，因滥权不起诉罪是本刑五年以上重罪，检方依职权提起再议，“高检署”日前也驳回，由于马英九只是告发，并非本案当事人，因此，不能申请交付审判，此部分早已确定。
马英九：攸关正义 非为个人而告
马英九锲而不舍要告侯宽仁引发社会议论，对此，台当局“总统府”公共事务室主任蔡仲礼昨日转述马英九的谈话指出，马英九认为，这是司法公平正义的问题，他并非为了个人利益而告，而是为了千千万万人的权益，因为这种事很可能发生在其他人的身上，“这不是一件小事，是有关原则与司法正义的问题”，也是司法改革很重要的一部分，马英九认为应该从他本身开始做起。
至于有关司法程序这一部分，包括马英九会不会亲自出庭的问题，蔡仲礼表示，马全权委托律师宋耀明对外说明。
来源： 新华网